Калькулятор молекулярної маси білка

Автор: Henrick Yau
- July 21, 2026
| |

Калькулятор молекулярної маси білка

0
Дійсний

Молекулярна маса білка обчислюється як сума середніх ізотопних мас його амінокислотних залишків:

\[ MW = \sum (n_i \times MW_i) - (n_{пептид} \times MW_{H_2O}) \]

Де:

  • \(n_i\) = Кількість кожної амінокислоти в послідовності
  • \(MW_i\) = Молекулярна маса кожної амінокислоти
  • \(n_{пептид}\) = Загальна кількість пептидних зв'язків
  • \(MW_{H_2O}\) = Молекулярна маса молекули води (18,02 Да)

Що таке калькулятор молекулярної маси білка?

Калькулятор молекулярної маси білка допомагає визначити молекулярну масу білка на основі його амінокислотної послідовності або складу. Він також обчислює додаткові властивості, такі як теоретична ізоелектрична точка (pI), коефіцієнт екстинкції, гідрофобність (показник GRAVY) та чистий заряд при pH 7.

Як користуватися калькулятором

Калькулятор пропонує кілька способів введення даних про білок:

  • Метод послідовності: Введіть послідовність білка, використовуючи однолітерні коди амінокислот.
  • Метод складу: Вручну введіть кількість кожної амінокислоти.
  • Розширені параметри: Застосуйте модифікації, такі як ацетилювання, дисульфідні зв'язки або термінальні модифікації.

Ключові особливості

  • Обчислює молекулярну масу як у Дальтонах (Да), так і в кілодальтонах (кДа).
  • Визначає теоретичну pI на основі значень pKa амінокислот.
  • Обчислює коефіцієнт екстинкції для УФ-поглинання при 280 нм.
  • Оцінює гідрофобність за допомогою показника GRAVY.
  • Враховує спеціальні модифікації, такі як фосфорилювання, метилювання та амідування.

Чому важлива молекулярна маса білка?

Знання молекулярної маси білка є важливим для:

  • Електрофоретичного аналізу (SDS-PAGE, Вестерн-блотинг).
  • Ідентифікації за допомогою мас-спектрометрії.
  • Очищення білків та хроматографії.
  • Структурних та функціональних досліджень.

Поширені запитання

Як обчислюється теоретична pI?

Ізоелектрична точка (pI) — це pH, при якому білок не має чистого заряду. Вона обчислюється за допомогою рівняння Гендерсона-Гассельбаха:

\[ pI = \frac{pKa_{поз} + pKa_{нег}}{2} \]

Що таке коефіцієнт екстинкції?

Коефіцієнт екстинкції обчислюється з використанням кількості залишків триптофану (W), тирозину (Y) та цистину (C):

\[ \varepsilon = (n_W \times 5500) + (n_Y \times 1490) + (n_C \times 125) \]

Як калькулятор обробляє модифікації?

Калькулятор дозволяє застосовувати різні посттрансляційні модифікації, які додаються або віднімаються від молекулярної маси білка.

Що таке показник GRAVY?

Показник GRAVY (Grand Average of Hydropathy) — це міра гідрофобності білка. Він обчислюється як:

\[ GRAVY = \frac{\sum (Гідропатія_{АК} \times n_{АК})}{Загальна\ кількість\ амінокислот} \]

Чому молекула води включається в розрахунок?

Утворення кожного пептидного зв'язку призводить до втрати однієї молекули води, тому загальна маса відповідно коригується.

Висновок

Калькулятор молекулярної маси білка є цінним інструментом для дослідників та студентів у біохімії та молекулярній біології. Незалежно від того, чи аналізуєте ви структуру білка, проводите експерименти або інтерпретуєте результати, цей інструмент швидко та точно надає основні молекулярні властивості.